NetBean中如何增加缓存


在<NetBeans_home>\etc\下,有个netbeans.conf,打开它后,找到netbeans_default_options=这一行,在这个上面即可修改-Xms和-Xmx,这可以增加JVM的缓存。如:netbeans_default_options=”-J-Xms384m -J-Xmx512m -J-XX:PermSize=32m -J-XX:MaxPermSize=96m -J-Xverify:none”,将会有384m的RAM,和最大的RAM512m。编程

生物信息学数据库


 生物信息学的基础是各种数据库的建立和分析工具的发展。迄今为止,生物学数据库总数已达500 个以上。归纳起来可分为4 大类:即基因组数据库、核酸和蛋白质一级结构数据库、生物大分子三维空间结构数据库,以及以上述3类数据库和文献资料为基础构建的二级数据库。常用生物信息学数据库:生物信息

European Molecular Biology Laboratory(EMBL) ———欧洲分子生
物学实验室http :/ / www1ebi1ac1uk/ ebi- docs/ embl- db/ ebi/
topembl1html
UK Human Genome Mapping Project – Resource Center (HGMP -
RC) ———英国医学研究委员会所属人类基因组图谱资源中
心http :/ / www1hgmp1mrc1ac1uk/ default1htm
SeqNet :UK Node of European Molecular Biology Network ( EMB2
Ne t) ———欧洲分子生物学信息网http :/ /
www1seqnet1dl1ac1uk/ default1htm
GenBank ———美国国家生物技术信息中心(NCBI) 所维护的
供公众自由读取的、带注释的DNA 序列的总数据库http :/ /
www1ncbi1nlm1nih1gov/ Web/ Search/ index1html

 

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microRNA的形成于作用


MicroRNA 的形成MicroRNA即miRNA,为一类长约21nt 的非编码单链小分子RNA。双链DNA的模板链和反义链均可作为编码MicroRNA  的模板,最初生成具70bp茎环结构及5’cap 和3’ polyA 的初级转录产物即Pri -MicroRNA,并由 Drosha 核酸酶切割生成70bp的茎环结构即Pre-  MicroRNA。后者由胞核进入胞质,在核酸内切酶Dicer 作用下生成成熟单链MicroRNA进而形成 RNA 诱导沉默复合体RISC。成熟的MicroRNA 5’-  端的磷酸基团和3’-端羟基则是MicroRNA 与相同长度的功能RNA 降解片段的区分标志。RISC可非特异结合于靶mRNA 的3’UTR(Untranslated Regions,即非翻译区),从而调控基因表达。 
MicroRNA 的作用和发生机制按MicroRNA与靶mRNA 作用模式可分为3 种:1)与靶基因不完全互补结合, 抑制翻译而不影响mRNA 的稳定性,  如线虫lin-4;2)与靶基因完全互补结合,特异性切  割靶mRNA,如miR-39、miR-171;3) 同时具备以上2种作用模式, 如果蝇及Hela 细胞中的MicroRNA  let-7。研究表明MicroRNA 通过上述方式能同多达200 种靶基因结合,

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CSS中outline属性介绍


outline是画在div边框border外面的线,一般是为了突出内容。outline的熟悉包括了 style,color,和outline的宽度 width

绿程网列出了outline的属性列表

属性 描述 CSS
outline 将所有outline属性放在一个声明内

outline-color
outline-style
outline-width
inherit

2
outline-color 设置outline的颜色

color_name
hex_number
rgb_number
invert
inherit

2
outline-style 设置outline的样式

none
dotted
dashed
solid
double
groove
ridge
inset
outset
inherit

2
outline-width 设置outline的宽度

thin
medium
thick
length
inherit

2

Java包的创建与运行


一个java包将相关的类和接口都放在一起,通常都执行某一方面的功能,比如java.awt包就包含了画图的组件。
java包也可以对变量和方法的定义更清晰。比如,通过使用存储修饰语protected,只有在相同的包中的类才能使用这个类或方法了。
绿程网将介绍不用IDE工具如何在windows系统下用记事本编写含有包的类以及它的运行。
1 首先编写个简单的类,HelloWorld.java,在命令行下使用java.java即可编译
HelloWorld.java
public class HelloWorld{
    public static void main(String[] args){
        System.out.println(”Hello World”);
    }
}
2 创建一个java包,名字可以任取,比如绿程网设置了D:\scjp\ex重要的是对环境变量进行设置
    在系统属性中打开环境变量设置窗口
    在系统变量中打开classpath
    加入;D:\scjp\ex

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java正则表达式列表


\\d表示   0-9   的数字,
\\s表示   空格,回车,换行等空白符,
\\w表示单词字符(数字字母下划线)
+号表示一个或多个的意思

microRNA与肿瘤


MicroRNA 是一类长度约为22nt 的单链非编码  小分子RNA,在生物进化过程中高度保守,通过  与靶基因序列的3′非翻译区特异性结合,诱导  靶mRNA 降解或阻遏其翻译.目前研究表明,  microRNA 参与多个生物学进程,包括干细胞维  持、骨骼肌肉系统、循环系统以及神经系统的发  育、胰岛素分泌和致癌性转化等.  近些年来,microRNA 参与肿瘤的发生已经成  为一个不争的事实, 大量的研究也已经证实  microRNA 具有抑癌和促癌的双重作用,从而为肿  瘤的研究又开辟了一条新的思路.绿程网

NCBI中fasta格式的命名规则


 
image 
绿程网列出几个fasta命名的例子,举一反三就一目了然了。

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FlashFXP修改文件打开方式


绿程网认为FlashFXP是一个灵活,小巧,好用的ftp工具。

当我们用记事本打开ftp中的文件时,可能因为编码的原因会改变文件而带来麻烦。以下介绍如何修改FlashFXP的打开方式。

image

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p53转录因子


p53 作为一种与DNA 特异性结合的转录因子  已被人们广泛研究,它在DNA 损伤、NO 或癌基  因等应激信号刺激下活化,从而激活下游靶基因,  引起DNA 修复、细胞凋亡和细胞周期停滞等一系  列生物学效应.

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绿程网坚持自由、开放、共享的原则

围绕web开发生物分析提供免费的在线编程教程生物教程等资源。